Cortar los zucchinis a lo largo. Quitar las semillas con una cuchara y colocar en una fuente enmantecada. Reservar.
Rehogar la cebolla con la panceta, y agregar la pulpa de los zucchinis. Añadir un poco de harina y leche. Cuando espese, retirar del fuego y agregar el choclo (previamente cocido), los huevos y salpimentar con nuez moscada.
Colocar el relleno dentro de los zucchinis, agregar queso rallado por encima y llevar a horno precalentado a 180°C para gratinar o hasta que los zucchinis estén tiernos.